В клировой ведомости Вознесенской церкви села Елагино значится, что каменная церковь построена в 1760 г. на средства помещика генерал-майора Неофита Кудрявцева.
В храме находился особо чтимый образ пророка и крестителя Иоанна Предтечи, который, по преданию, даровал сам царь Иоанн Грозный с тем, чтобы здесь основать монастырь. По неизвестной причине замысел царя не был осуществлен, а икона стала местной святыней.
Стены внутренних помещений храма украшала живопись, от которой сохранилось лишь одно изображение на своде прохода царских врат.
При церкви была библиотека на 120 томов. Церковно-приходская школа существовала с 1884 года. В 1909 году в селе Елагино было 105 дворов и 569 жителей.
Храм закрыли в конце 1930-х годов и передали для колхозных нужд. В 1970-х годах люди из Елагино стали уезжать, село пришло в упадок. После 1963 г. в справочных изданиях село больше не упоминается.
