Селение Селенгуши основано в 1740-х годах. Каменный храм в стиле барокко во имя Усекновения главы Иоанна Предтечи построен в 1763 г. на средства помещицы Марии Шамшевой. Церковь была с пределами во имя Святителя Николая Чудотворца и иконы Божией Матери «Знамение» (позднее упраздненный).
В начале ХХ в. в селе проживало около 400 жителей. Здесь располагались: волостное правление, земская школа, хлебозапасные магазины, кузница, казённая винная и мелочная лавки.
В 1930-х гг. храм был закрыт. До сегодняшнего дня сохранились подлинные кресты на куполах XVIII–XIX вв. и крест на месте иконостаса.
В 1971 г. в селе закрываются последние производства: машинотракторная станция и молочный завод. Люди начинают уезжать из деревни в поисках работы. При переезде жители разбирали и увозили свои дома, сложенные из бревен. Сейчас сохранилось только 3 дома. По переписи населения в 2010 году в Селенгушах проживал 1 человек — 95-летняя Надежда Захарова. В 2023 году деревня не имеет постоянных жителей.
